18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0525 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0525  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  310  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  46.23 
 
 
179 aa  89  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  45.1 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  41.18 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  36.17 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  27.81 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  35.65 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  36.27 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  36.73 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  31.68 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  31.45 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  34.91 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2352  hypothetical protein  42.25 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  28.08 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  39 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  29.87 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  28.71 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  29.32 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>