12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2128 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  239  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0468443  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0351  hypothetical protein  51.54 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.74 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.09 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.73 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.38 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.65 
 
 		 156 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>