56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0045 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0023  tRNA-Gly  90.14 
 
 
71 bp  85.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.135769  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0049  tRNA-Gly  88.14 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.151378 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0050  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0938912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0025  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  85.71 
 
 
71 bp  54  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0030  tRNA-Glu  96.3 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.290488  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0069  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.299902  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4319  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0301  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000859433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0229  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000723342  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0279  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0018  tRNA-Gly  96.15 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0843457 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0017  tRNA-His  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5666  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000047392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>