30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0010 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0021  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0006  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.467617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0052  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.707391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    93.55 
 
 		 203 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>