18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2989 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  222  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0868  hypothetical protein  32.23 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.213532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2262  hypothetical protein  31.13 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  31.68 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  44.07 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0537  hypothetical protein  32.67 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  40.35 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  31.71 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  32.47 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  35.11 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3762  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000079403  normal  0.0464919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4931  hypothetical protein  31.17 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0903429  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  33.78 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2181  hypothetical protein  30.28 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16221  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4376  hypothetical protein  37.93 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000005005  unclonable  0.00000000143863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  33.01 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4314  hypothetical protein  37.93 
 
 
110 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>