29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1622 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1622  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 		 157 aa  316  9e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1021  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  71.15 
 
 		 145 aa  207  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3330  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  58.29 
 
 		 174 aa  202  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1390  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  56.07 
 
 		 171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2542  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  60.84 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.34 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.11 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  37.5 
 
 		 436 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 473 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  36.07 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  40.98 
 
 		 433 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.98 
 
 		 433 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4045  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.98 
 
 		 433 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000364507  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  27.87 
 
 		 454 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  40.98 
 
 		 433 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.98 
 
 		 433 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2923  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.98 
 
 		 433 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  34.78 
 
 		 466 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  40.98 
 
 		 433 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.98 
 
 		 433 aa  41.6  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 69 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.98 
 
 		 433 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 69 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 69 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  30.43 
 
 		 448 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 471 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>