164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0409 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  55.32 
 
 
692 aa  701    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  65.82 
 
 
680 aa  890    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  62.57 
 
 
679 aa  826    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  64.53 
 
 
675 aa  847    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  100 
 
 
672 aa  1371    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  39 
 
 
499 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  36.39 
 
 
495 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  36 
 
 
499 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  36.84 
 
 
507 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  35.71 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  35.71 
 
 
499 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  37.39 
 
 
500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  33.88 
 
 
513 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  35.44 
 
 
467 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  34.5 
 
 
775 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  35.07 
 
 
898 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  29.95 
 
 
459 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  31.16 
 
 
462 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  31.36 
 
 
471 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  31.12 
 
 
478 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  30.4 
 
 
472 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  29.31 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  30.79 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  30.34 
 
 
466 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  30.11 
 
 
475 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  29.91 
 
 
470 aa  147  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  29.91 
 
 
470 aa  147  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  30.31 
 
 
473 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  29.24 
 
 
470 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  29.66 
 
 
485 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  30.23 
 
 
470 aa  145  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  30.35 
 
 
472 aa  144  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  30.35 
 
 
472 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  30.35 
 
 
472 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  31.59 
 
 
449 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  31.59 
 
 
449 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  30.06 
 
 
472 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  30.06 
 
 
472 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  30.38 
 
 
269 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  29.67 
 
 
269 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  29.44 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  28.49 
 
 
507 aa  114  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  28.49 
 
 
507 aa  114  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  29.94 
 
 
517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  28.08 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  28.82 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  30.12 
 
 
532 aa  112  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  28.12 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.217683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  27.86 
 
 
510 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  111  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  28.12 
 
 
520 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  27.86 
 
 
510 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  111  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  111  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  111  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  111  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  28.61 
 
 
517 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  28.37 
 
 
502 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  28.37 
 
 
502 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  29.19 
 
 
523 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  27.98 
 
 
521 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  28.32 
 
 
542 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  28.45 
 
 
508 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  28.45 
 
 
508 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  28.57 
 
 
522 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  27.86 
 
 
510 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  30.69 
 
 
416 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  27.27 
 
 
510 aa  108  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  28.45 
 
 
508 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  27.09 
 
 
511 aa  108  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  27.57 
 
 
510 aa  107  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  27.22 
 
 
515 aa  107  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  28.03 
 
 
505 aa  107  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  28.45 
 
 
508 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  27.04 
 
 
511 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  27.09 
 
 
511 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  27.04 
 
 
511 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  27.84 
 
 
520 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  27.14 
 
 
507 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  26.72 
 
 
419 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  28.11 
 
 
520 aa  105  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  27.73 
 
 
538 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  26.49 
 
 
519 aa  104  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  28.45 
 
 
522 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  27.87 
 
 
508 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  28.45 
 
 
522 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  28.45 
 
 
522 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  28.91 
 
 
560 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  28.91 
 
 
560 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  27.59 
 
 
516 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  28.91 
 
 
560 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  28.91 
 
 
560 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  28.91 
 
 
560 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  28.91 
 
 
560 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  28.91 
 
 
560 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>