12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4994 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  100 
 
 
1510 aa  3100    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  35.64 
 
 
1342 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  29.15 
 
 
1187 aa  322  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  36.84 
 
 
751 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  36.84 
 
 
747 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  34.88 
 
 
170 aa  50.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  32.2 
 
 
190 aa  48.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  21.01 
 
 
906 aa  46.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  46.15 
 
 
579 aa  45.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1687  putative type IV secretory pathway VirD4 components  24.53 
 
 
784 aa  45.1  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00283538  normal  0.176159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  38.2 
 
 
1143 aa  45.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  27.55 
 
 
231 aa  45.1  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>