18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4353 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  777    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  48.4 
 
 
407 aa  329  4e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  47.91 
 
 
416 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  46.09 
 
 
372 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  48.87 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  41.01 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  39.43 
 
 
380 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  39.71 
 
 
394 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  36.58 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  34.46 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  33.25 
 
 
380 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  33.33 
 
 
369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4505  hypothetical protein  79.17 
 
 
206 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  29.31 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.38 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  24.34 
 
 
285 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  25.49 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.66 
 
 
294 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>