21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4295 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  95.56 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  82.96 
 
 		 133 aa  238  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  79.67 
 
 		 130 aa  216  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  74.8 
 
 		 134 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  73.17 
 
 		 134 aa  200  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  32.77 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  30.25 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  24.17 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  27.72 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  23.42 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  22.31 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  29.9 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  28.77 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  21.1 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 275 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>