36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3509 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3509  peptidase S26B, signal peptidase  100 
 
 
391 aa  768    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3743  peptidase S26B, signal peptidase  60.89 
 
 
385 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0480  peptidase S26B, signal peptidase  45.95 
 
 
387 aa  280  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.466927  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1326  peptidase S26B, signal peptidase  50.98 
 
 
338 aa  279  7e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1382  peptidase S26B, signal peptidase  46.81 
 
 
381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3375  peptidase S26B, signal peptidase  42.39 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4175  peptidase S26B, signal peptidase  41.87 
 
 
372 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0980  peptidase S26B, signal peptidase  43.92 
 
 
194 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27603 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  36.36 
 
 
179 aa  61.2  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2822  peptidase S26B, signal peptidase  25.96 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1261  peptidase S26B, signal peptidase  23.82 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.634938  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0232  peptidase S26B, signal peptidase  30.21 
 
 
183 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.197402 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  38.46 
 
 
197 aa  56.6  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  39.44 
 
 
166 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  39.44 
 
 
166 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  35.43 
 
 
197 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0863  putative phage repressor  40.22 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0292  putative phage repressor  39.13 
 
 
129 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0000355656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0847  peptidase S26B, signal peptidase  31.34 
 
 
180 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0999  peptidase S26B, signal peptidase  26.74 
 
 
191 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00791277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  36.54 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1909  hypothetical protein  35.9 
 
 
202 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  36.36 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  41.98 
 
 
618 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1367  signal peptidase I  31.31 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.22388e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4015  signal peptidase I  33.33 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107234  hitchhiker  0.000000016155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1329  signal peptidase I  33.33 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1431  signal peptidase I  29.2 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.102172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1389  signal peptidase I  29.2 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1287  signal peptidase I  31.31 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.334276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1172  signal peptidase I  31.31 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1170  signal peptidase I  31.31 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1191  signal peptidase I  31.31 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0334924  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2836  peptidase S26B, signal peptidase  30.82 
 
 
177 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1191  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
189 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4034  peptidase S26B, signal peptidase  35.53 
 
 
216 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0285496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>