21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3399 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
173 aa  340  4e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1346  hypothetical protein  54.29 
 
 
208 aa  198  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.956224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.26 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.11 
 
 
161 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.61 
 
 
162 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0993082  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1941  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.04 
 
 
166 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 
136 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.38 
 
 
136 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.68 
 
 
124 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 
141 aa  57.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 
114 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.54 
 
 
125 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
126 aa  48.5  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.04 
 
 
114 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 
117 aa  44.3  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2827  hypothetical protein  33.75 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.96 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 
122 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  34.02 
 
 
124 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
106 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>