60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07280 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_07280  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  100 
 
 		 138 aa  271  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.44175e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3888  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00280663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3697  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000192847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3587  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3605  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3860  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54783e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3984  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1298  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000324783  hitchhiker  8.48184e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3945  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000161258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3894  putative DNA-binding protein  46.53 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000001182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1367  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  42.73 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000121359  normal  0.130704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3669  putative DNA-binding protein  45.54 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1977  putative DNA-binding protein  52.22 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2498  putative DNA-binding protein  45.54 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00012288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1714  putative DNA-binding protein  51.81 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000280165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0771  putative helix-turn-helix protein, YlxM/p13-like protein  59.46 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000112996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1522  putative DNA-binding protein  51.52 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0239246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2057  putative DNA-binding protein  56 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000575566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1086  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  47.19 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0708  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  54.05 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1195  putative DNA-binding protein  49.33 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00566112  normal  0.0879522 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1156  putative DNA-binding protein  38.39 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000235308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0914  putative DNA-binding protein  52.7 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00185411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0983  putative DNA-binding protein  52.7 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1499  hypothetical protein  54.67 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0744431  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0654  putative DNA-binding protein  47.3 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000927978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1295  putative DNA-binding protein  36.73 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000113338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1320  putative DNA-binding protein  36.73 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000787485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2410  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  45.35 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1686  putative DNA-binding protein  44.66 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000027159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1350  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  37.38 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000485447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0965  putative helix-turn-helix protein, YlxM/p13-like  39.56 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000337599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1968  putative DNA-binding protein  43.69 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0784  hypothetical protein  46.91 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000115289  hitchhiker  3.01315e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1305  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  43.21 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000161782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0966  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  47.95 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000131133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3762  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  47.3 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407263  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0802  putative DNA-binding protein  42.68 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186415  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0480  putative DNA-binding protein  47.3 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0438504  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1419  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  39.02 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1451  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  33.66 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1562  hypothetical protein  40.62 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl238  putative DNA-binding protein  42.47 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf058  hypothetical protein  43.75 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1861  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  38.16 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000519848  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0456  hypothetical protein  41.54 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00302471  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0158  putative DNA-binding protein  38.81 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.123109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3892  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  38.03 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1908  sigma-70, region 4 type 2  47.92 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3249  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00663689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0705  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.83 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0842  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  44.68 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.786617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2896  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.7 
 
 		 203 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1154  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  44.44 
 
 		 201 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.449216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0866  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1415  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  51.43 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183042  normal  0.106327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5800  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.3 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0787  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  46.81 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.678164  normal  0.0288483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2293  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.22 
 
 		 201 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1427  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40 
 
 		 201 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.518653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>