35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf058 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf058  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07280  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  43.75 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.44175e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0966  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  44.23 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000131133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1419  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  35.48 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1714  putative DNA-binding protein  40.38 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000280165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0771  putative helix-turn-helix protein, YlxM/p13-like protein  39.06 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000112996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0965  putative helix-turn-helix protein, YlxM/p13-like  35.71 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000337599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0480  putative DNA-binding protein  42.37 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0438504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0654  putative DNA-binding protein  42.31 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000927978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0914  putative DNA-binding protein  39.29 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00185411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2498  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00012288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3697  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000192847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3587  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3669  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3984  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3888  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00280663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1367  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  37.5 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000121359  normal  0.130704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3605  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3894  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000001182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3945  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000161258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1298  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000324783  hitchhiker  8.48184e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3860  putative DNA-binding protein  34.43 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54783e-61 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0983  putative DNA-binding protein  39.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1350  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  32.76 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000485447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1522  putative DNA-binding protein  36.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0239246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2410  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  36.54 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000167585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1086  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  38.46 
 
 		 110 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1861  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  48.72 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000519848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0708  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  35.38 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725888  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1451  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  38.33 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0784  hypothetical protein  30.51 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000115289  hitchhiker  3.01315e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1305  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  32.81 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000161782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2057  putative DNA-binding protein  36.54 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000575566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1195  putative DNA-binding protein  37.5 
 
 		 121 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00566112  normal  0.0879522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1977  putative DNA-binding protein  34.62 
 
 		 110 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>