46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1499 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1499  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  228  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0744431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1367  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  50.45 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000121359  normal  0.130704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2057  putative DNA-binding protein  49.07 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000575566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3762  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  48.11 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1195  putative DNA-binding protein  47.9 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00566112  normal  0.0879522 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3587  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3605  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3984  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3860  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54783e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1298  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000324783  hitchhiker  8.48184e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3697  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000192847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3945  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000161258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3894  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000001182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3888  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00280663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1977  putative DNA-binding protein  54.12 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3669  putative DNA-binding protein  50.46 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1086  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  60 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2498  putative DNA-binding protein  62.67 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00012288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1522  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0239246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0983  putative DNA-binding protein  43.3 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.584872  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1156  putative DNA-binding protein  54.05 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000235308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0914  putative DNA-binding protein  47.62 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00185411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07280  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  54.67 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.44175e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1686  putative DNA-binding protein  47.57 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000027159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1714  putative DNA-binding protein  46.08 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000280165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0965  putative helix-turn-helix protein, YlxM/p13-like  51.9 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000337599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1968  putative DNA-binding protein  47.57 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0654  putative DNA-binding protein  39.81 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000927978  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0784  hypothetical protein  52.56 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000115289  hitchhiker  3.01315e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2410  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  48.68 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0708  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  42.68 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0771  putative helix-turn-helix protein, YlxM/p13-like protein  46.99 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000112996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0802  putative DNA-binding protein  43.56 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0966  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  34.55 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000131133  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1295  putative DNA-binding protein  48.65 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000113338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1320  putative DNA-binding protein  48.65 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000787485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1305  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  45.07 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000161782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0456  hypothetical protein  45.07 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00302471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1350  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  35.87 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000485447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1562  hypothetical protein  46.34 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1861  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  36.26 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000519848  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1451  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  44.26 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0158  putative DNA-binding protein  35.11 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.123109  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl238  putative DNA-binding protein  34.69 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0480  putative DNA-binding protein  40.54 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0438504  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1419  putative helix-turn-helix protein YlxM/p13 family protein  38.36 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>