38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0050 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0050    100 
 
 		 360 bp  714    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0043    100 
 
 		 350 bp  65.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0036    100 
 
 		 350 bp  65.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0043    100 
 
 		 350 bp  65.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0015    96.77 
 
 		 375 bp  54  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0080    94.29 
 
 		 397 bp  54  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0028    96.67 
 
 		 373 bp  52  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0035    94.12 
 
 		 370 bp  52  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.451039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0050    96.67 
 
 		 376 bp  52  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0030    94.12 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540536  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0038    93.94 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0019    93.94 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0016    96.55 
 
 		 373 bp  50.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    93.75 
 
 		 360 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0005    93.75 
 
 		 425 bp  48.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0016    93.75 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0003    93.75 
 
 		 358 bp  48.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.162726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0001    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tmRNA1  10Sa RNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0038    93.55 
 
 		 366 bp  46.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_006368  lpptmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpltmRNA1    93.55 
 
 		 405 bp  46.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3005  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0020    93.55 
 
 		 361 bp  46.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1628  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0060    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0016    93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0011    93.55 
 
 		 367 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0189  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0032    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0495012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0032    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0507829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0054    93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.413577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0034    93.55 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0241117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0010    93.55 
 
 		 367 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0045    93.55 
 
 		 349 bp  46.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.858368  normal  0.0337314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2584  sRNA  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0958  10Sa RNA (tmRNA)  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2956  10Sa RNA (tmRNA)  93.55 
 
 		 370 bp  46.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>