22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0026 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0026  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0391108  normal  0.06286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0044  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000299707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0011  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0018  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0018  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.800845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0032  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0020  tRNA-Glu  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00671129  hitchhiker  0.00000169389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0031  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0018  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000034168  normal  0.183849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0025  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0472989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0013  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000327585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0067  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0013  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18757e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0025  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28107e-23 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00674188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0021  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.228053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0006  tRNA-Val  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.642038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>