45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4589 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.71 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  33.64 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  41.11 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  28.72 
 
 		 843 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4722  type IV pilus assembly PilZ  36.62 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal  0.959626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1622  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 112 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  34.78 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000872155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3328  hypothetical protein  31.01 
 
 		 121 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3472  type IV pilus assembly PilZ  31.18 
 
 		 121 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3408  type IV pilus assembly PilZ  31.18 
 
 		 121 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  26.61 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.41 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3392  type IV pilus assembly PilZ  34.33 
 
 		 121 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  26.17 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  31.25 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000155004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  26.73 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  26.17 
 
 		 118 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3745  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4213  response regulator receiver domain-containing protein  27.22 
 
 		 487 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.871258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0720  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00112805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.63 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4345  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.22 
 
 		 487 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0926285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  31.46 
 
 		 760 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0134  type IV pilus assembly PilZ  35.94 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00895059  normal  0.836798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0733  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000127746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3886  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.33 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3802  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.33 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0707641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  39.33 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1608  type IV pilus assembly PilZ  31.91 
 
 		 109 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0391991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4368  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.47 
 
 		 487 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1436  Type IV pilus assembly PilZ  31.4 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2331  2-alkenal reductase  28.72 
 
 		 778 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0761037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2419  2-alkenal reductase  28.72 
 
 		 771 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2350  DnaK family protein  30.09 
 
 		 782 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.646727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  28.18 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1696  hypothetical protein  38.78 
 
 		 115 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1614  2-alkenal reductase  30.09 
 
 		 779 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1519  2-alkenal reductase  30.09 
 
 		 778 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  28.68 
 
 		 252 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  28.68 
 
 		 252 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  28.68 
 
 		 252 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  28.68 
 
 		 252 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  28.68 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>