More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4214 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.4 
 
 
491 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
487 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.07 
 
 
491 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
488 aa  966    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.58 
 
 
491 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
487 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.16 
 
 
487 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.86 
 
 
491 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.8 
 
 
487 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.25 
 
 
494 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.32 
 
 
489 aa  632  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.73 
 
 
489 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.56 
 
 
489 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.02 
 
 
486 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.35 
 
 
489 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.78 
 
 
486 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
485 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
485 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.82 
 
 
488 aa  608  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  62.14 
 
 
486 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.03 
 
 
483 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  60.82 
 
 
484 aa  611  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.59 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.73 
 
 
493 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.11 
 
 
490 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.62 
 
 
486 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.41 
 
 
487 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.32 
 
 
485 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
508 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.81 
 
 
490 aa  600  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.28 
 
 
507 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
486 aa  598  1e-170  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.44 
 
 
486 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.66 
 
 
494 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.7 
 
 
482 aa  595  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.67 
 
 
504 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.78 
 
 
487 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.95 
 
 
485 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.49 
 
 
488 aa  597  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.49 
 
 
482 aa  595  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.29 
 
 
484 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.74 
 
 
486 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  59.47 
 
 
490 aa  591  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  59.47 
 
 
490 aa  591  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.82 
 
 
490 aa  593  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.74 
 
 
486 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2497  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.58 
 
 
485 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0704163  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
496 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.4 
 
 
489 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.86 
 
 
485 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.82 
 
 
490 aa  593  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.95 
 
 
486 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.33 
 
 
488 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.95 
 
 
486 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 
486 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.74 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.74 
 
 
487 aa  588  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.74 
 
 
486 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.25 
 
 
492 aa  588  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.54 
 
 
486 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.29 
 
 
486 aa  589  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
496 aa  591  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.57 
 
 
488 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
487 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1014  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.43 
 
 
488 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.74 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.27 
 
 
514 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.7 
 
 
486 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60 
 
 
487 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
486 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.96 
 
 
485 aa  587  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
486 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.36 
 
 
486 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
486 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
488 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
486 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.42 
 
 
489 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
486 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
487 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  59.67 
 
 
484 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
486 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
486 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.91 
 
 
485 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
489 aa  586  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00905  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.42 
 
 
485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0297709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.81 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.54 
 
 
486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.59 
 
 
489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.14 
 
 
485 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.51 
 
 
487 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 
488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.2 
 
 
490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.54 
 
 
497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.57 
 
 
489 aa  579  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.09 
 
 
487 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.76 
 
 
485 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.38 
 
 
487 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.3 
 
 
556 aa  578  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.61 
 
 
487 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>