More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4202 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  50.22 
 
 
692 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  49.4 
 
 
692 aa  655    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  51.49 
 
 
689 aa  668    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  51.18 
 
 
692 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  49.55 
 
 
691 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  47.89 
 
 
707 aa  644    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  48.96 
 
 
692 aa  648    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  53.51 
 
 
689 aa  701    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  49.78 
 
 
691 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  48.9 
 
 
703 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  50.07 
 
 
680 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  48.96 
 
 
692 aa  649    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  49.78 
 
 
691 aa  652    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  47.85 
 
 
692 aa  636    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  50.15 
 
 
695 aa  643    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  49.11 
 
 
692 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  49.11 
 
 
692 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  48.96 
 
 
692 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  48.96 
 
 
692 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  51.78 
 
 
691 aa  674    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  48.6 
 
 
694 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  48.6 
 
 
694 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  49.93 
 
 
699 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  48.77 
 
 
704 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  49.11 
 
 
692 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  49.05 
 
 
702 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  49.93 
 
 
692 aa  663    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.41 
 
 
696 aa  646    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  49.63 
 
 
691 aa  658    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  50.22 
 
 
702 aa  639    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  49.11 
 
 
691 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  49.85 
 
 
697 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  49.85 
 
 
692 aa  670    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  47.85 
 
 
693 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  48.83 
 
 
703 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  48.83 
 
 
704 aa  636    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  49.18 
 
 
691 aa  644    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  48.91 
 
 
704 aa  652    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  49.7 
 
 
691 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  51.62 
 
 
692 aa  685    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  49.85 
 
 
697 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  48.9 
 
 
706 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  49.71 
 
 
700 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  49.18 
 
 
691 aa  641    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  49.11 
 
 
692 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  49.55 
 
 
691 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  49.11 
 
 
691 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  48.96 
 
 
694 aa  643    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  48.75 
 
 
696 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  50 
 
 
704 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  50 
 
 
692 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  51.34 
 
 
692 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  49.26 
 
 
692 aa  654    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  49.33 
 
 
692 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  49.56 
 
 
689 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.82 
 
 
703 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  48.32 
 
 
704 aa  641    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  49.4 
 
 
692 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  50.74 
 
 
699 aa  671    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  49.93 
 
 
699 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  51.1 
 
 
692 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  49.93 
 
 
691 aa  655    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  49.33 
 
 
689 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  49.85 
 
 
691 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  51.18 
 
 
692 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  49.63 
 
 
700 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  49.19 
 
 
703 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  49.48 
 
 
691 aa  650    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.3 
 
 
692 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  49.78 
 
 
697 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.78 
 
 
691 aa  649    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  50 
 
 
698 aa  636    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  49.85 
 
 
692 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.71 
 
 
697 aa  651    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  48.61 
 
 
704 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  51.2 
 
 
690 aa  681    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  50.59 
 
 
692 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  50.74 
 
 
691 aa  684    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  48.98 
 
 
698 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  50 
 
 
692 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2953  elongation factor G  48.69 
 
 
708 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00010566  hitchhiker  0.00000914286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  49.41 
 
 
700 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  49.12 
 
 
700 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  49.12 
 
 
704 aa  645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  48.88 
 
 
694 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  49.48 
 
 
691 aa  651    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  49.93 
 
 
691 aa  664    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  49.26 
 
 
692 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  49.05 
 
 
704 aa  651    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  50.59 
 
 
699 aa  670    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  48.66 
 
 
693 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  52.88 
 
 
706 aa  734    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  48.96 
 
 
691 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>