19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2949 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  50.67 
 
 
83 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  51.61 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  47.76 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  49.15 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  44.26 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  35.71 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  47.37 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  34.29 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  48 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  37.7 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2047  hypothetical protein  35.82 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  39.68 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  30 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  34.43 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  34.55 
 
 
107 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  30.16 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>