More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1978 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
473 aa  948    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.47 
 
 
638 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
450 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.02 
 
 
916 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.72 
 
 
658 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
687 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 
612 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
651 aa  170  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.3 
 
 
598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
636 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4282  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 
1145 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.82 
 
 
593 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
776 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  32.43 
 
 
634 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  38.31 
 
 
1073 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.57 
 
 
517 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.42 
 
 
667 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  37.59 
 
 
790 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 
673 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.86 
 
 
668 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.35 
 
 
676 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
642 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.86 
 
 
641 aa  159  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
569 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  36.78 
 
 
1034 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  39.07 
 
 
519 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  38.87 
 
 
1358 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  33.97 
 
 
641 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.06 
 
 
1655 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  36.73 
 
 
1053 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  36.33 
 
 
1057 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 
520 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  34.78 
 
 
618 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  37.31 
 
 
586 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2187  serine/threonine protein kinase  40.73 
 
 
477 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.74 
 
 
591 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.01 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.96 
 
 
646 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  36.93 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.97 
 
 
406 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  33.83 
 
 
692 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.03 
 
 
650 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
612 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  35.51 
 
 
617 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
746 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  33.66 
 
 
614 aa  153  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.09 
 
 
653 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
729 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  34.15 
 
 
457 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3878  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 
396 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
557 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
344 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
468 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 
398 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2641  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
382 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.643401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
450 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
596 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  34.31 
 
 
672 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
382 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.78 
 
 
681 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
487 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
661 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.96 
 
 
662 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0290  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
453 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
480 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.46 
 
 
625 aa  150  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.02 
 
 
476 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
497 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2186  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.19 
 
 
610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.84 
 
 
627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  36.76 
 
 
661 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
1479 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.02 
 
 
584 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.64 
 
 
660 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.93 
 
 
1044 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.84 
 
 
863 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  37.23 
 
 
488 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
581 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
610 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
710 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.62 
 
 
757 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.57 
 
 
850 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.65 
 
 
621 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.62 
 
 
652 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.67 
 
 
579 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  36.67 
 
 
758 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30.37 
 
 
662 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.73 
 
 
647 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.71 
 
 
603 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
703 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  35.31 
 
 
660 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
632 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
641 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.71 
 
 
1036 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.4 
 
 
655 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.56 
 
 
635 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>