22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1176 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  167  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  54.79 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  50.67 
 
 
76 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  54.17 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  55.07 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  47.17 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  51.92 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  39.47 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  39.47 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1913  hypothetical protein  35.71 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1924  hypothetical protein  35.71 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  41.82 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  33.77 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  34.25 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  31.58 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0175  hypothetical protein  34.85 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  33.75 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  29.49 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>