17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0873 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0873  PGAP1 family protein  100 
 
 		 1257 aa  2539    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.730318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6273  Hyalin  63.23 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1135  hypothetical protein  52.7 
 
 		 962 aa  264  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  27.91 
 
 		 382 aa  54.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  36.17 
 
 		 589 aa  51.6  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  34.35 
 
 		 414 aa  50.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  27.84 
 
 		 438 aa  48.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45215  predicted protein  33.06 
 
 		 456 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0954  hypothetical protein  25 
 
 		 1354 aa  48.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000910199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3199  hypothetical protein  38.27 
 
 		 972 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  29.45 
 
 		 474 aa  47  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  27.27 
 
 		 418 aa  46.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  32.5 
 
 		 488 aa  46.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.54 
 
 		 1776 aa  46.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1243 aa  45.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  33.33 
 
 		 393 aa  45.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  31.25 
 
 		 487 aa  45.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>