23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0279 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  100 
 
 		 135 aa  276  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  45.93 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.19 
 
 		 135 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  39.69 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  42.19 
 
 		 355 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  43.36 
 
 		 360 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  44.25 
 
 		 349 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  37.78 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  34.92 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  38.76 
 
 		 356 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  34.81 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  34.81 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  32.79 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  31.97 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  37.17 
 
 		 355 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.83 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.23 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>