227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3385 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  100 
 
 
81 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  71.25 
 
 
81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  71.6 
 
 
81 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  71.6 
 
 
81 aa  120  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  67.95 
 
 
84 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  48.15 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  48.15 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000431331  decreased coverage  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  45.68 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  52 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  55.71 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  52.11 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  44.44 
 
 
194 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  46.84 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  49.37 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  45.57 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  46.84 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  46.84 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  44.44 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  46.84 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  46.84 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  45.57 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  47.37 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  42.67 
 
 
76 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  44 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  45.68 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  44 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  42.11 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  44 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  41.33 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  41.33 
 
 
76 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  41.33 
 
 
76 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  41.33 
 
 
76 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  42.67 
 
 
76 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  41.33 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.19 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  42.47 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  37.84 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  37.84 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  39.19 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  43.06 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  42.03 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  43.42 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  34.62 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.19 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  39.51 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  39.51 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  42.67 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  37.33 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  36.49 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  44.93 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  42.03 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  37.33 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  36.49 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  43.24 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  44.59 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  43.48 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  42.86 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  39.73 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  42.03 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  36 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  38.96 
 
 
76 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  39.13 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  41.43 
 
 
83 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  37.18 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  35.21 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  35.21 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  45.71 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  35.14 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  37.68 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  40.58 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  40.28 
 
 
76 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  42.03 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  37.68 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  36.23 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  34.72 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  34.25 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  34.29 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  40.79 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  35.71 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  31.58 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  39.13 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  39.13 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  32.43 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  32.43 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  30.26 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  39.13 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  38.89 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  33.33 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  34.29 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  39.13 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>