20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0349 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0349  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  508  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.192947 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1724  copper ABC transporter permease  48.06 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2679  copper ABC transporter permease  44.91 
 
 
300 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  38.66 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.49 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.08 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.14 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  27.75 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  26.92 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  32.95 
 
 
298 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  28.9 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  28.9 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  19.75 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  28.9 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  29.36 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  25.31 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>