13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3263 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3263  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4529  transcriptional regulator TrmB  64.04 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1078  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2669  transcriptional regulator, TrmB  40.66 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2775  transcriptional regulator TrmB  42.01 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2456  transcriptional regulator TrmB  33.12 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.189668  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0157  hypothetical protein  31.75 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3623  hypothetical protein  32.54 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1666  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1057  transcriptional regulator, TrmB  27.03 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.607328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 302 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>