33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1779 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1779  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 257 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.116318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  51.81 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  53.69 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  47.89 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1424  Prephenate dehydrogenase  47.18 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  24.79 
 
 		 437 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  25.85 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  21.98 
 
 		 443 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  22.27 
 
 		 443 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  22.18 
 
 		 439 aa  52.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  22.91 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 		 374 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  24.76 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  22.91 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  29.57 
 
 		 375 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 379 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26 
 
 		 383 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 383 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 383 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  30.33 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  21.33 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  27.57 
 
 		 373 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 379 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.5 
 
 		 384 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  27.57 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  30.83 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.15 
 
 		 384 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  25.89 
 
 		 375 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>