36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0310 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0310  Protein of unknown function DUF650  100 
 
 
430 aa  861    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1108  Protein of unknown function DUF650  66.05 
 
 
433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2606  Protein of unknown function DUF650  66.28 
 
 
433 aa  554  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1972  Protein of unknown function DUF650  65.22 
 
 
426 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3192  Protein of unknown function DUF650  63.93 
 
 
427 aa  549  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0326  hypothetical protein  35.34 
 
 
406 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.25053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0532  hypothetical protein  34.7 
 
 
407 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0243  hypothetical protein  34.29 
 
 
406 aa  226  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0593  hypothetical protein  33.77 
 
 
406 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0514  hypothetical protein  32.12 
 
 
431 aa  222  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00307015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1658  hypothetical protein  32.59 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.487866  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0226  Protein of unknown function DUF650  33.25 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2047  hypothetical protein  32.84 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000156756  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0943  hypothetical protein  35.11 
 
 
418 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0199  hypothetical protein  35.23 
 
 
398 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1859  Protein of unknown function DUF650  32.65 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1863  hypothetical protein  35.09 
 
 
382 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1781  hypothetical protein  33.83 
 
 
408 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0394  hypothetical protein  34.39 
 
 
410 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1702  hypothetical protein  32.73 
 
 
399 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.456812  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2780  Protein of unknown function DUF650  33.72 
 
 
390 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1368  hypothetical protein  36.06 
 
 
395 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.642046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0555  Protein of unknown function DUF650  34.13 
 
 
397 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0789329  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0584  hypothetical protein  32.29 
 
 
387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.183239  decreased coverage  0.000387048 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1128  hypothetical protein  33.24 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.157954  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0958  hypothetical protein  33.61 
 
 
399 aa  173  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0243215  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0975  hypothetical protein  29.05 
 
 
385 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1337  hypothetical protein  33.69 
 
 
403 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.984704  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1830  hypothetical protein  33.42 
 
 
406 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2157  hypothetical protein  32.46 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300379  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0623  hypothetical protein  29.35 
 
 
410 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1209  hypothetical protein  32.07 
 
 
378 aa  143  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.7498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1571  hypothetical protein  30.26 
 
 
402 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0317  hypothetical protein  33.53 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0271  hypothetical protein  34.3 
 
 
402 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>