17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1960 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1662  hypothetical protein  51 
 
 		 188 aa  89.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2476  hypothetical protein  38.21 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2194  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1707  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0705  hypothetical protein  32.81 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0258  cytochrome c family protein  41.86 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1847  cytochrome c family protein  29.63 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374574  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0237  cytochrome c family protein  34.68 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1777  cytochrome c family protein  30.16 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1946  hypothetical protein  32.03 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0039  hypothetical protein  29.92 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0138  hypothetical protein  31.37 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0581411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2273  cytochrome c family protein  32.23 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.758488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0452  cytochrome c family protein  23.08 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.653469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0068  cytochrome c family protein  30.47 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.424004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2311  hypothetical protein  30.86 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>