40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0386 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1401  hypothetical protein  45.45 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.036318  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2229  hypothetical protein  61.11 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.955597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  48.98 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  48.98 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1117  hypothetical protein  57.89 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.180887 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1511  hypothetical protein  61.11 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00462794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1926  hypothetical protein  61.11 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  52.78 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  40.91 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0513  hypothetical protein  61.11 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0611  hypothetical protein  61.11 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5533  hypothetical protein  61.11 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2030  hypothetical protein  61.11 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1568  hypothetical protein  55.26 
 
 
48 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.652462 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0778  hypothetical protein  61.11 
 
 
48 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2094  hypothetical protein  61.11 
 
 
48 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1072  hypothetical protein  46.94 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17261  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  52.63 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  43.94 
 
 
86 aa  43.5  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  47.54 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  58.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  58.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1952  hypothetical protein  54.55 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313889  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  45 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1439  hypothetical protein  55.56 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2409  hypothetical protein  55.56 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.472359  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  52.78 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4625  hypothetical protein  55.56 
 
 
73 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000865793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  43.4 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  46.34 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  50 
 
 
54 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  51.22 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1804  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2170  hypothetical protein  52.63 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  36.92 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3071  hypothetical protein  52.78 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0673605  normal  0.301271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1999  hypothetical protein  34.29 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.311882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  47.22 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2571  hypothetical protein  55.56 
 
 
67 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0219978  hitchhiker  0.000328028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>