12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5089 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  812    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
440 aa  87  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
441 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 
612 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  26.02 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.945271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  26.42 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  20.77 
 
 
1197 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_192  polysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 
129 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.880283  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 
1297 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>