More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5023 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5023  integrase catalytic region  100 
 
 		 292 aa  604  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5050  integrase catalytic region  61.15 
 
 		 435 aa  330  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  24.2 
 
 		 167 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  25.93 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  26.88 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  33.06 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  33.06 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  33.06 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  33.06 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  33.06 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  25 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  32.23 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  25 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1743  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2426  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2414  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  25 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4290  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4272  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.489775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3925  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  26.77 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  25.19 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  28.47 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  26.77 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  25.19 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  21.43 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  27.69 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  23.66 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>