23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1918 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1051    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  30.24 
 
 
504 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  28.27 
 
 
474 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  28.08 
 
 
472 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  23.98 
 
 
576 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  24.03 
 
 
597 aa  77  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1677  CRISPR-associated RAMP protein  24.17 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.71005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  28.24 
 
 
622 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  27.73 
 
 
594 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  24.5 
 
 
415 aa  67  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  30.87 
 
 
274 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  24.38 
 
 
443 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  29.67 
 
 
558 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.78 
 
 
282 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.27 
 
 
288 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.15 
 
 
260 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0184  hypothetical protein  24.87 
 
 
548 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1228  protein of unknown function DUF324  22.94 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  27.85 
 
 
257 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  24.89 
 
 
289 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  27.27 
 
 
280 aa  53.9  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  28.57 
 
 
299 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  24.87 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0712178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>