More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0362 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0362  acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 		 420 aa  852    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.39 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.64 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  48.92 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  49.03 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.51 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  47.71 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  49.03 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  49.03 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  49.03 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  49.03 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  49.03 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  47.6 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  48.79 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  48.79 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  48.79 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  49.64 
 
 		 395 aa  362  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  48.19 
 
 		 392 aa  362  9e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  47.82 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  50.48 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  50.48 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  50.48 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  50.48 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  50.48 
 
 		 394 aa  359  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  46.32 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  46.32 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  50.24 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  46.78 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  46.51 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  47.23 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  46.51 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  46.51 
 
 		 392 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3352  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3237  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 		 392 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000800068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3171  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 		 392 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3251  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 		 392 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3188  acetyl-CoA acetyltransferase  48.55 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 392 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  48.19 
 
 		 401 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  47.32 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  46.54 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  47.71 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47.71 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  47.32 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  46.41 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.48 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  47.32 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  47.23 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  47.23 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  48.19 
 
 		 392 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 		 393 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  47.71 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  48.19 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  47.23 
 
 		 393 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.86 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  47.2 
 
 		 394 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  47.1 
 
 		 391 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47.1 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  48.29 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  46.88 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5467  acetyl-CoA acetyltransferase  46.28 
 
 		 427 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00479259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5193  acetyl-CoA acetyltransferase  46.52 
 
 		 393 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5044  acetyl-CoA acetyltransferase  46.52 
 
 		 393 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5589  acetyl-CoA acetyltransferase  46.52 
 
 		 393 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  45.56 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1665  Acetyl-CoA acetyltransferase  47.75 
 
 		 379 aa  349  5e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  47.23 
 
 		 393 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5437  acetyl-CoA acetyltransferase  46.76 
 
 		 427 aa  348  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000615424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  47.33 
 
 		 391 aa  348  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 		 393 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 		 393 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 		 393 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 		 393 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5028  acetyl-CoA acetyltransferase  46.28 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.38 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5485  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000736039  hitchhiker  2.33e-22 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  47.2 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>