More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3568 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3568  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 401 aa  830    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4270  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  44.56 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.5 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.03 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.18 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5479  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0777  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.82 
 
 		 430 aa  263  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.48 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1931  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 		 430 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  40.21 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  38.73 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  41.38 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.63 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.47 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  41.64 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  41.11 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  38.73 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 382 aa  239  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  40.32 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  38.99 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.19 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  37.19 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  38.38 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  38.38 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  36.84 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  40.05 
 
 		 490 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  40.05 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  40.05 
 
 		 415 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.78 
 
 		 637 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.95 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.77 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.77 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.77 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.77 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.5 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.87 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  39.14 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.22 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 358 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.77 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.77 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>