35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3421 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  100 
 
 
91 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  74.44 
 
 
91 aa  146  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  59.09 
 
 
91 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0921  prevent-host-death family protein  65.12 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.387734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  61.18 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  28.05 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  37.5 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0908  prevent-host-death protein  31.58 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00165129  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  31.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  30.38 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  38.78 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  31.65 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  29.17 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  31.43 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  32.39 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  40.38 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  26.39 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  32 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  31.43 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0291  hypothetical protein  32.39 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  32.39 
 
 
93 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  36.96 
 
 
74 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  30.38 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  26.32 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  30.56 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>