More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1032 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  46.69 
 
 
692 aa  646    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2529  elongation factor G  69.23 
 
 
689 aa  924    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  100 
 
 
688 aa  1389    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1032  elongation factor G  65.3 
 
 
703 aa  904    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  46.51 
 
 
691 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  62.66 
 
 
691 aa  853    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  68.7 
 
 
688 aa  945    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  46.3 
 
 
692 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  46.28 
 
 
689 aa  648    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  46.61 
 
 
692 aa  638    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  46.82 
 
 
689 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  47.73 
 
 
706 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  68.09 
 
 
684 aa  935    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  46.24 
 
 
689 aa  635  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  45.87 
 
 
692 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  45.76 
 
 
691 aa  634  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  45.85 
 
 
692 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  45.58 
 
 
692 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  45.72 
 
 
692 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  44.99 
 
 
697 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  45.87 
 
 
692 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  45.59 
 
 
695 aa  629  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  47.67 
 
 
701 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  46.69 
 
 
700 aa  631  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  45.58 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  45.58 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  45.58 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  45.58 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  45.05 
 
 
705 aa  625  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  46.28 
 
 
691 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  45.58 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  46.35 
 
 
688 aa  627  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  44.13 
 
 
692 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  45.43 
 
 
692 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  44.25 
 
 
691 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  45.94 
 
 
692 aa  624  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.23 
 
 
700 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  47.55 
 
 
701 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  44.99 
 
 
692 aa  618  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  44.66 
 
 
692 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  44.35 
 
 
692 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  44.81 
 
 
692 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  45.17 
 
 
689 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  44.75 
 
 
699 aa  620  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  44.69 
 
 
698 aa  621  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  44.69 
 
 
693 aa  620  1e-176  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  44.51 
 
 
692 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  44.92 
 
 
699 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  46.78 
 
 
695 aa  615  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  45.77 
 
 
689 aa  618  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  45.71 
 
 
692 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  44.8 
 
 
699 aa  618  1e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  46.03 
 
 
699 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  45.41 
 
 
691 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  46.03 
 
 
699 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  44.87 
 
 
697 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  44.1 
 
 
689 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  46.63 
 
 
690 aa  615  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  44.67 
 
 
697 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.1 
 
 
692 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.34 
 
 
691 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  45.44 
 
 
700 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  45.62 
 
 
697 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.12 
 
 
692 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  44.67 
 
 
697 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  46.22 
 
 
702 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  45.3 
 
 
704 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  45.63 
 
 
697 aa  612  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  46.58 
 
 
680 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  44.67 
 
 
697 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  45.29 
 
 
699 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  45.02 
 
 
690 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  44.28 
 
 
692 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.87 
 
 
715 aa  611  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  44.38 
 
 
694 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  44.21 
 
 
691 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  43.26 
 
 
700 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  44.36 
 
 
692 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  45.08 
 
 
691 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  42.61 
 
 
690 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  45.7 
 
 
691 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  43.71 
 
 
701 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  43.92 
 
 
691 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  43.74 
 
 
697 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  44.71 
 
 
698 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  43.26 
 
 
692 aa  606  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  43.71 
 
 
701 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  44.21 
 
 
691 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  43.26 
 
 
700 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  45.39 
 
 
691 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  43.71 
 
 
701 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  43.99 
 
 
694 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  43.85 
 
 
694 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  44.61 
 
 
694 aa  605  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  43.91 
 
 
691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  45.08 
 
 
706 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  44.07 
 
 
691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  43.92 
 
 
692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  43.91 
 
 
691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>