35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0379 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  357  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  61.31 
 
 
165 aa  221  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  55.49 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  54.88 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  52.98 
 
 
172 aa  184  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  40.94 
 
 
172 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  34.21 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  32.5 
 
 
179 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  30.87 
 
 
163 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  33.99 
 
 
159 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  31.54 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  29.41 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  32.43 
 
 
170 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  31.13 
 
 
167 aa  89  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  30.72 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  30.46 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  28.1 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  32.85 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  32.85 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  30.88 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  27.15 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  27.15 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  27.15 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  28.57 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  28.48 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  27.45 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  21.84 
 
 
89 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>