13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4272 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4272  SAF domain protein  100 
 
 		 317 aa  565  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.575112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  40.74 
 
 		 214 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  37.5 
 
 		 224 aa  85.9  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  37.93 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  40.58 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  45.86 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  32.84 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  35.94 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  39.53 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  35.25 
 
 		 213 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  30.07 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  40.95 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>