20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3419 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22390  hypothetical protein  51.38 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3736  hypothetical protein  50.91 
 
 		 111 aa  95.9  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  hitchhiker  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  41.67 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1754  hypothetical protein  46.73 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  46.3 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0195  hypothetical protein  40.38 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  49.32 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  46.3 
 
 		 231 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0792  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  37.5 
 
 		 226 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  44.23 
 
 		 386 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  40.38 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.704326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5788  hypothetical protein  39.29 
 
 		 329 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2900  hypothetical protein  40.38 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000404833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4312  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  40.38 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  35.42 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3783  hypothetical protein  38.98 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00138484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  32.73 
 
 		 284 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>