60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3329 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  54.55 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  57.64 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  57.64 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  53.1 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  58.22 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  53.1 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  55.24 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  53.1 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  53.42 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  51.39 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  50.69 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  46.85 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  43.36 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  45.52 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  36.81 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  37.24 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  36.81 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  36.81 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  36.81 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  34.27 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  29.17 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  31.54 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  29.45 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  29.45 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  29.45 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  29.32 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  23.19 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  22.46 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  21.01 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  21.01 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  21.01 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  24.48 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>