70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1086 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
261 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1137  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
350 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
320 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4142  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
320 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  36.4 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  40.49 
 
 
297 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
295 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
277 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0558  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  35.89 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353174  hitchhiker  0.0086157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.89 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  33.07 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  28.69 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1191  GCN5-related N-acetyltransferase  35.08 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  32.79 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.641949  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
412 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
271 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10433  hypothetical protein  32.14 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.243356  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  29.75 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  27.35 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0181113  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1940  acetyltransferase  23.27 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1867  acetyltransferase  23.27 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.551401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
175 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
244 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4384  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0795208  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  26.27 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.100489 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3159  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  49.02 
 
 
152 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0921004  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5170  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
196 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0925  putative acetyl transferase  43.55 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2584  GCN5-related N-acetyltransferase  43.55 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0546703  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3332  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
196 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877658 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3355  gentamicin 3'-N-acetyltransferase  49.02 
 
 
152 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2189  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  31.53 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  47.27 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36.51 
 
 
151 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3427  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10971  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.91 
 
 
131 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0263282  normal  0.176049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  29.23 
 
 
154 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
860 aa  43.5  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4460  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.23 
 
 
172 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00479194  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0467  GCN5-like N-acetyltransferase  40.38 
 
 
187 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1282  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 
145 aa  42.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
202 aa  42  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.278949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>