16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0371 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0371  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  815    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3937  membrane protein  36.58 
 
 		 808 aa  229  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183856  normal  0.16689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1062  membrane protein  37.11 
 
 		 615 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0559  hypothetical protein  37.36 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.309462  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3189  hypothetical protein  37.28 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.127447  hitchhiker  0.0000558428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0791  O-antigen and teichoic acid-like export protein  35.42 
 
 		 1273 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750231  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2389  putative integral membrane protein  36.94 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00613681  normal  0.0209947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5602  hypothetical protein  33.8 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0755  hypothetical protein  26.54 
 
 		 361 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6390  hypothetical protein  25.95 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2502  O-antigen and teichoic acid-like export protein  41.1 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4583  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.358999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5044  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740829  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1822  hypothetical protein  30.83 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000473849  normal  0.0325575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3798  hypothetical protein  24.18 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.878935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5354  hypothetical protein  28.57 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.124865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>