58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3492 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  100 
 
 		 73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0848  ferredoxin family protein, putative  76.71 
 
 		 73 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  66.67 
 
 		 63 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  66.67 
 
 		 63 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 64 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  68.25 
 
 		 62 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  68.25 
 
 		 64 aa  90.5  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  68.25 
 
 		 64 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  65.08 
 
 		 62 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3169  ferredoxin family protein, putative  59.68 
 
 		 64 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1093  ferredoxin family protein, putative  59.68 
 
 		 64 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  62.9 
 
 		 63 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.25 
 
 		 63 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  56.45 
 
 		 317 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  56.45 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  53.23 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  53.23 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  43.94 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  46.15 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  43.64 
 
 		 349 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.42 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.88 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  42.86 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1897  ferredoxin  38.1 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.09 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7956  predicted protein  45.16 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346454  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15971  ferredoxin  40.98 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1921  Ferredoxin-like protein  38.71 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.207385  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2579  ferredoxin  36.23 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  36.23 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.68 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  36.23 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.86 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0839  Ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00930022 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9697  predicted protein  39.34 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.012492  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2647  ferredoxin  39.34 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16791  hypothetical protein  33.73 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0107  ferredoxin  37.7 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.8941  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1749  ferredoxin  34.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.855381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  43.1 
 
 		 62 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1570  hypothetical protein  34.94 
 
 		 119 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  43.1 
 
 		 62 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  46.43 
 
 		 60 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5089  ferredoxin  37.7 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.536243  normal  0.0695219 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16571  hypothetical protein  36.51 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.262713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3217  hypothetical protein  33.87 
 
 		 64 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.634688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>