More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1975 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  69.72 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  56.84 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  50.34 
 
 
293 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  50.88 
 
 
285 aa  299  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  51.42 
 
 
294 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  48.57 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0909  metal-dependent phosphoesterase  48.57 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  41.18 
 
 
282 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  37.67 
 
 
285 aa  178  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  37.5 
 
 
278 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  36.71 
 
 
287 aa  175  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  41.8 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  37.98 
 
 
264 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  39.84 
 
 
287 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  37.24 
 
 
279 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  38.21 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  37.63 
 
 
288 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  36.75 
 
 
291 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5748  PHP domain protein  38.72 
 
 
299 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  38.13 
 
 
286 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  38.16 
 
 
294 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  39.92 
 
 
279 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  35.93 
 
 
287 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  36.95 
 
 
287 aa  158  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  35.43 
 
 
270 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  34.92 
 
 
287 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  39.53 
 
 
285 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  37.99 
 
 
289 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  32.81 
 
 
279 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  39.39 
 
 
280 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0712  PHP domain protein  37.23 
 
 
290 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  35.14 
 
 
284 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  35.55 
 
 
279 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  32.42 
 
 
267 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  39.84 
 
 
273 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  34.23 
 
 
286 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  37.55 
 
 
275 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  37.25 
 
 
274 aa  148  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  36.26 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  34.39 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  36.82 
 
 
286 aa  145  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  34.73 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  38.16 
 
 
275 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  34.88 
 
 
278 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  36.19 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  33.71 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  34.09 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  35.8 
 
 
286 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  37.74 
 
 
286 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  33.21 
 
 
276 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  37.26 
 
 
286 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  36.4 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  35.41 
 
 
282 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  37.64 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  34.6 
 
 
280 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  34.87 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  37.4 
 
 
297 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  34.96 
 
 
288 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  32.84 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  37.79 
 
 
280 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  35.29 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  33.58 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  31.64 
 
 
297 aa  129  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  35.81 
 
 
296 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  35.8 
 
 
282 aa  129  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  32.17 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  32.81 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  34.2 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  38.2 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  37.27 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  33.08 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  33.21 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  33.97 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  34.5 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  32.84 
 
 
303 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  31.03 
 
 
291 aa  125  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  39.33 
 
 
295 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  32.34 
 
 
286 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  33.98 
 
 
278 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  35.02 
 
 
284 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  32.34 
 
 
286 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27790  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  37.98 
 
 
284 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0386409  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  32.94 
 
 
286 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  32.94 
 
 
286 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  34.73 
 
 
286 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  29.5 
 
 
269 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  31.97 
 
 
286 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  39.25 
 
 
284 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  34.35 
 
 
286 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  34.35 
 
 
302 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  35.11 
 
 
286 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  31.6 
 
 
286 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  34.35 
 
 
302 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2570  putative phosphoesterase  35.5 
 
 
276 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  34.2 
 
 
293 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1985  phosphotransferase domain-containing protein  33.21 
 
 
309 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000791669 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1458  putative phosphoesterase  35.5 
 
 
276 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>