176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1829 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  78.45 
 
 
543 aa  790    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  100 
 
 
543 aa  1086    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  56.58 
 
 
561 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  50.64 
 
 
557 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  50.45 
 
 
557 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  38.2 
 
 
562 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  33.45 
 
 
557 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.9 
 
 
536 aa  313  6.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.9 
 
 
556 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.88 
 
 
548 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.48 
 
 
576 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.76 
 
 
541 aa  290  6e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.32 
 
 
541 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.75 
 
 
541 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.72 
 
 
574 aa  279  9e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.43 
 
 
541 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.83 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.73 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  30.39 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  31.01 
 
 
537 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.14 
 
 
538 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.73 
 
 
559 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.12 
 
 
549 aa  258  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.72 
 
 
551 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  29.95 
 
 
551 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  29.95 
 
 
551 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  29.76 
 
 
551 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  29.76 
 
 
551 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  29.76 
 
 
551 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  29.95 
 
 
551 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  29.58 
 
 
544 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  29.58 
 
 
551 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.38 
 
 
567 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  29.4 
 
 
551 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.47 
 
 
584 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.13 
 
 
566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.84 
 
 
555 aa  243  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.84 
 
 
555 aa  243  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  30.81 
 
 
559 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.19 
 
 
551 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.01 
 
 
590 aa  238  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1780  Na+/Pi-cotransporter  31.93 
 
 
544 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.68 
 
 
556 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.36 
 
 
563 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.57 
 
 
586 aa  226  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.5 
 
 
643 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  27.89 
 
 
549 aa  220  5e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  29.84 
 
 
535 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.16 
 
 
636 aa  209  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.19 
 
 
564 aa  208  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.55 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.51 
 
 
565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.95 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.49 
 
 
570 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.35 
 
 
587 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.71 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  30.23 
 
 
555 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  29 
 
 
586 aa  179  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.53 
 
 
318 aa  170  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.59 
 
 
535 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  27.91 
 
 
600 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  27.87 
 
 
592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  28.49 
 
 
566 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  30.09 
 
 
554 aa  160  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  29.27 
 
 
559 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  27.81 
 
 
563 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.97 
 
 
556 aa  146  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  25.46 
 
 
563 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.05 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  27.11 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.93 
 
 
565 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  32.27 
 
 
304 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.05 
 
 
552 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  34.13 
 
 
289 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.62 
 
 
562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  25.6 
 
 
565 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2510  Na+/H+ antiporter  27.29 
 
 
572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  27.45 
 
 
565 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  23.03 
 
 
556 aa  135  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.7 
 
 
577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  22.62 
 
 
560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.73 
 
 
576 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  23.26 
 
 
558 aa  130  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  23.08 
 
 
558 aa  130  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  24.62 
 
 
561 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2947  Na+/Picotransporter  29.34 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.89 
 
 
562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  26.67 
 
 
561 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  30.41 
 
 
308 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.38 
 
 
310 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.91 
 
 
556 aa  127  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.91 
 
 
556 aa  126  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  27.54 
 
 
578 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  22.83 
 
 
582 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  24.35 
 
 
548 aa  123  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2701  Na+/Pi-cotransporter  28.45 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  23.92 
 
 
548 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.39 
 
 
311 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  22.45 
 
 
582 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.52 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>