34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1779 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  855    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  59 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  62.95 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  63.69 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  63.99 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  41.9 
 
 		 481 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  42.62 
 
 		 472 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  41.44 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  41.51 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  42.99 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  42.13 
 
 		 473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  41.44 
 
 		 481 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  41.44 
 
 		 481 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  39.35 
 
 		 474 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  40.6 
 
 		 474 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  40.6 
 
 		 474 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  41.4 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  39.91 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  40.78 
 
 		 475 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  40.48 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  42.57 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  44.03 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  39.55 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  37.5 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  24.55 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.87 
 
 		 286 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.72 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.76 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0072  thioredoxin domain-containing protein  35.62 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  20.65 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  20.32 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  23.82 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0866  hypothetical protein  30.14 
 
 		 173 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  20.67 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>