19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0496 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  63.75 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  45.68 
 
 		 83 aa  85.5  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  51.9 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  46.05 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  46.05 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  41.18 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 787 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  30.12 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 778 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  48.72 
 
 		 796 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  30.77 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  31.71 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  32.26 
 
 		 805 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 798 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  40.38 
 
 		 441 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 777 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 831 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>